29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4218 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4218  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.564347  normal  0.125187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3486  hypothetical protein  61.9 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3291  hypothetical protein  65.09 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.527484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3159  hypothetical protein  62.38 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.180987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1260  hypothetical protein  61.39 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4063  hypothetical protein  61.39 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1207  hypothetical protein  58.49 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3879  putative lipoprotein  44 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2287  hypothetical protein  31.86 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0058  putative lipoprotein  43.06 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2997  putative lipoprotein  40.26 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0126  putative lipoprotein  40.26 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1540  putative lipoprotein  40.26 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3924  putative lipoprotein  40.26 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3063  putative lipoprotein  39.74 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3995  hypothetical protein  39.74 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3307  putative lipoprotein  39.74 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3002  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.227334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0144  hypothetical protein  41.33 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146202  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0134  hypothetical protein  39.74 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0146  hypothetical protein  39.74 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3256  putative lipoprotein  37.66 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0147  hypothetical protein  39.74 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2908  hypothetical protein  39.74 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0160  hypothetical protein  39.74 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3326  hypothetical protein  37.18 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1964  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0941183  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1586  lipoprotein  37.84 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1636  lipoprotein  36.11 
 
 		 125 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0899246  normal  0.710086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>