13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1543 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1543  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  322  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2033  hypothetical protein  31.73 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3304  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.143996  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2592  hypothetical protein  30.91 
 
 		 265 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.757678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3040  hypothetical protein  38.1 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0844725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2287  hypothetical protein  36.49 
 
 		 248 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2777  hypothetical protein  41.43 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.861732  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3768  hypothetical protein  39.68 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.128649  normal  0.0419519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3378  hypothetical protein  36 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1331  hypothetical protein  36.56 
 
 		 208 aa  43.9  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.685242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2201  hypothetical protein  29.13 
 
 		 107 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000755119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3291  hypothetical protein  33.96 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.527484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1815  hypothetical protein  27.81 
 
 		 199 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>