17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05220 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00396  hypothetical protein  86.62 
 
 		 569 aa  1040    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0648901  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_003296  RS05220  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1278    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44910  hypothetical protein  32.5 
 
 		 569 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00907398  normal  0.870076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5268  hypothetical protein  31.64 
 
 		 592 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  30.49 
 
 		 685 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01939  putative transmembrane protein  32.34 
 
 		 497 aa  173  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  31.37 
 
 		 539 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6903  hypothetical protein  26.95 
 
 		 646 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0637  hypothetical protein  26.6 
 
 		 644 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0116  hypothetical protein  34.45 
 
 		 248 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  33.97 
 
 		 230 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  33.97 
 
 		 230 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  34.44 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  34.44 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  27.41 
 
 		 876 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  27.41 
 
 		 876 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  31.16 
 
 		 414 aa  44.3  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>