14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0637 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6903  hypothetical protein  80.93 
 
 
646 aa  1053    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0637  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1328    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0116  hypothetical protein  85.71 
 
 
248 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  89.29 
 
 
230 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  89.29 
 
 
230 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  92.67 
 
 
206 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  92.67 
 
 
206 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5268  hypothetical protein  31.76 
 
 
592 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01939  putative transmembrane protein  33.69 
 
 
497 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44910  hypothetical protein  30.39 
 
 
569 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00907398  normal  0.870076 
 
 
-
 
NC_003296  RS00396  hypothetical protein  27.66 
 
 
569 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0648901  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_003296  RS05220  hypothetical protein  26.92 
 
 
612 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  32.13 
 
 
539 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  24.33 
 
 
685 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>