19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0290 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  100 
 
 
685 aa  1406    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  49 
 
 
539 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00396  hypothetical protein  30.67 
 
 
569 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0648901  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_003296  RS05220  hypothetical protein  30.49 
 
 
612 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01939  putative transmembrane protein  30.38 
 
 
497 aa  140  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5268  hypothetical protein  26.33 
 
 
592 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44910  hypothetical protein  28 
 
 
569 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00907398  normal  0.870076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0637  hypothetical protein  24.23 
 
 
644 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6903  hypothetical protein  26.99 
 
 
646 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0116  hypothetical protein  27.31 
 
 
248 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  33.04 
 
 
225 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  26.92 
 
 
230 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  26.92 
 
 
230 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  26.92 
 
 
206 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  26.92 
 
 
206 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  25.12 
 
 
876 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  25.12 
 
 
876 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  30.36 
 
 
312 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1868  hypothetical protein  27.56 
 
 
312 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.602901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>