14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0116 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0116  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0637  hypothetical protein  85.71 
 
 
644 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6903  hypothetical protein  82.25 
 
 
646 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  357  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  357  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  99.33 
 
 
206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  99.33 
 
 
206 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5268  hypothetical protein  38.26 
 
 
592 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01939  putative transmembrane protein  36.63 
 
 
497 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44910  hypothetical protein  36.1 
 
 
569 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00907398  normal  0.870076 
 
 
-
 
NC_003296  RS05220  hypothetical protein  35.44 
 
 
612 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00396  hypothetical protein  35.27 
 
 
569 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0648901  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  29.91 
 
 
539 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  27.51 
 
 
685 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>