14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6903 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6903  hypothetical protein  100 
 
 
646 aa  1337    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0637  hypothetical protein  80.93 
 
 
644 aa  1053    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0116  hypothetical protein  82.25 
 
 
248 aa  360  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  83.93 
 
 
230 aa  251  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  83.93 
 
 
230 aa  251  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  89.93 
 
 
206 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  89.93 
 
 
206 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5268  hypothetical protein  31.27 
 
 
592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01939  putative transmembrane protein  34.19 
 
 
497 aa  207  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44910  hypothetical protein  28.91 
 
 
569 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00907398  normal  0.870076 
 
 
-
 
NC_003296  RS00396  hypothetical protein  28.05 
 
 
569 aa  180  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0648901  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_003296  RS05220  hypothetical protein  27.22 
 
 
612 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  27.98 
 
 
539 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  28.18 
 
 
685 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>