14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01939 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01939  putative transmembrane protein  100 
 
 		 497 aa  1028    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44910  hypothetical protein  55.07 
 
 		 569 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00907398  normal  0.870076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5268  hypothetical protein  39.41 
 
 		 592 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0637  hypothetical protein  33.69 
 
 		 644 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6903  hypothetical protein  33.76 
 
 		 646 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00396  hypothetical protein  32.7 
 
 		 569 aa  183  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0648901  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_003296  RS05220  hypothetical protein  32.34 
 
 		 612 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  30.38 
 
 		 685 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  32.19 
 
 		 539 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0116  hypothetical protein  36.14 
 
 		 248 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  35.57 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  35.57 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  35.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  35.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>