26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01761 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01761  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3206  hypothetical protein  54.94 
 
 		 173 aa  173  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.831279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0523  hypothetical protein  53.46 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1864  small integral membrane protein  50.3 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2799  hypothetical protein  52.8 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2694  hypothetical protein  45.45 
 
 		 166 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2772  hypothetical protein  48.8 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  0.451239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0871  hypothetical protein  44.65 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3342  hypothetical protein  45.4 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3839  hypothetical protein  44.65 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.650899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0874  hypothetical protein  44.65 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1708  hypothetical protein  49.08 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330511  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5848  small integral membrane protein  50.35 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6215  small integral membrane protein  50.35 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0516112  hitchhiker  0.00564006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6691  small integral membrane protein  49.65 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756575  normal  0.318883 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0774  small integral membrane protein  44.37 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153266  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4705  hypothetical protein  40.13 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1746  hypothetical protein  39.51 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.342074  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6619  small integral membrane protein  49.62 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2198  hypothetical protein  37.34 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2226  hypothetical protein  35.44 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0560  small integral membrane protein  44.8 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2087  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  91.3  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0115  hypothetical exported membrane spanning protein  38.06 
 
 		 159 aa  91.3  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0935  hypothetical protein  31.17 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1426  hypothetical protein  34.82 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>