26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2694 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2694  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3342  hypothetical protein  75.46 
 
 
166 aa  266  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1708  hypothetical protein  61.49 
 
 
166 aa  203  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0874  hypothetical protein  55.35 
 
 
165 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0871  hypothetical protein  55.35 
 
 
165 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3839  hypothetical protein  55.35 
 
 
165 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.650899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6691  small integral membrane protein  55.48 
 
 
170 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756575  normal  0.318883 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5848  small integral membrane protein  55.48 
 
 
170 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6215  small integral membrane protein  55.48 
 
 
170 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0516112  hitchhiker  0.00564006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2772  hypothetical protein  51.52 
 
 
171 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  0.451239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2799  hypothetical protein  51.9 
 
 
163 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4705  hypothetical protein  52.53 
 
 
160 aa  153  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779443  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0774  small integral membrane protein  51.05 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153266  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6619  small integral membrane protein  55.97 
 
 
157 aa  148  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2226  hypothetical protein  45 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2198  hypothetical protein  45.62 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01761  hypothetical protein  45.45 
 
 
165 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1864  small integral membrane protein  42.68 
 
 
164 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3206  hypothetical protein  40.62 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.831279  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0523  hypothetical protein  43.48 
 
 
164 aa  124  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0115  hypothetical exported membrane spanning protein  50 
 
 
159 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2087  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1746  hypothetical protein  36.81 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.342074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0935  hypothetical protein  34.18 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0560  small integral membrane protein  38.36 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1426  hypothetical protein  27.66 
 
 
170 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>