24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1426 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1426  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  340  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3206  hypothetical protein  38.94 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.831279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0774  small integral membrane protein  31.58 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153266  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3342  hypothetical protein  30.5 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2226  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2799  hypothetical protein  33.63 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2087  hypothetical protein  32.08 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0115  hypothetical exported membrane spanning protein  32.08 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2198  hypothetical protein  23.72 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01761  hypothetical protein  34.82 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2694  hypothetical protein  27.66 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0874  hypothetical protein  26.71 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3839  hypothetical protein  26.71 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.650899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0871  hypothetical protein  26.71 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5848  small integral membrane protein  27.07 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6215  small integral membrane protein  27.07 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0516112  hitchhiker  0.00564006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0523  hypothetical protein  28.03 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1746  hypothetical protein  26.19 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.342074  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1708  hypothetical protein  28.95 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330511  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2772  hypothetical protein  31.31 
 
 		 171 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  0.451239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1864  small integral membrane protein  26.99 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6691  small integral membrane protein  26.32 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756575  normal  0.318883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0560  small integral membrane protein  29.57 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4705  hypothetical protein  38 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>