26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0871 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3839  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.650899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0871  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5848  small integral membrane protein  65.45 
 
 		 170 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6215  small integral membrane protein  65.45 
 
 		 170 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0516112  hitchhiker  0.00564006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6691  small integral membrane protein  65.45 
 
 		 170 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756575  normal  0.318883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1708  hypothetical protein  63.8 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2694  hypothetical protein  55.35 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3342  hypothetical protein  53.33 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6619  small integral membrane protein  62.5 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2198  hypothetical protein  55.9 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2226  hypothetical protein  55.28 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2772  hypothetical protein  51.25 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  0.451239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0523  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0774  small integral membrane protein  48.15 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153266  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_003296  RS01761  hypothetical protein  44.65 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.219891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3206  hypothetical protein  41.21 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.831279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1864  small integral membrane protein  46.88 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4705  hypothetical protein  48.75 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2799  hypothetical protein  46.84 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1746  hypothetical protein  40.85 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.342074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0935  hypothetical protein  36.5 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0115  hypothetical exported membrane spanning protein  40 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2087  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0560  small integral membrane protein  41.09 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1426  hypothetical protein  26.71 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>