29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2198 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2198  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2226  hypothetical protein  95.68 
 
 
162 aa  316  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0874  hypothetical protein  55.9 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3839  hypothetical protein  55.9 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.650899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0871  hypothetical protein  55.9 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1708  hypothetical protein  54.04 
 
 
166 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330511  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5848  small integral membrane protein  52.7 
 
 
170 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6215  small integral membrane protein  52.7 
 
 
170 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0516112  hitchhiker  0.00564006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6691  small integral membrane protein  52.7 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756575  normal  0.318883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2694  hypothetical protein  45.62 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3342  hypothetical protein  43.48 
 
 
166 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2772  hypothetical protein  45.06 
 
 
171 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  0.451239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6619  small integral membrane protein  52.59 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.786442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4705  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779443  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1864  small integral membrane protein  38.12 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0523  hypothetical protein  40.74 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0774  small integral membrane protein  40.14 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153266  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0935  hypothetical protein  37.89 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1746  hypothetical protein  35.98 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.342074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2799  hypothetical protein  41.88 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_003296  RS01761  hypothetical protein  37.34 
 
 
165 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.219891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3206  hypothetical protein  30.86 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.831279  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0115  hypothetical exported membrane spanning protein  37.4 
 
 
159 aa  89  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2087  hypothetical protein  37.4 
 
 
159 aa  89  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0560  small integral membrane protein  36.29 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1426  hypothetical protein  23.72 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1509  hypothetical protein  27.69 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793016  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0089  hypothetical protein  27.69 
 
 
166 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1592  hypothetical protein  28.46 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>