25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3761 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  100 
 
 		 317 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  88.96 
 
 		 317 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  79.81 
 
 		 317 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  69.5 
 
 		 319 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3692  hydroxyneurosporene synthase  56.38 
 
 		 297 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  53.5 
 
 		 404 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  53.2 
 
 		 300 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2952  hydroxyneurosporene synthase  52.19 
 
 		 299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2823  hydroxyneurosporene synthase  52.8 
 
 		 286 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.293634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2047  hydroxyneurosporene synthase  52.4 
 
 		 283 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.329916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2847  hydroxyneurosporene synthase  51.92 
 
 		 286 aa  286  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1615  hydroxyneurosporene synthase  44.65 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2985  hydroxyneurosporene synthase  48 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.813569  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0267  hydroxyneurosporene synthase  41.58 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2041  hydroxyneurosporene synthase  40.29 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.42927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1911  hydroxyneurosporene synthase  41.58 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0184  hydroxyneurosporene synthase  41.28 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3512  hydroxyneurosporene dehydrogenase  40.5 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.411163  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  23.74 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1988  hydroxyneurosporene synthase  22.12 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0180674  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  24.32 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0360  hydroxyneurosporene synthase  22.58 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0314991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1781  hydroxyneurosporene synthase  20.23 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0186399 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  21.9 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1720  hydroxyneurosporene synthase CrtC  21.08 
 
 		 380 aa  42.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000497436  normal  0.211478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>