20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0428 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  100 
 
 		 376 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0360  hydroxyneurosporene synthase  64.36 
 
 		 376 aa  519  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0314991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  62.47 
 
 		 376 aa  495  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1720  hydroxyneurosporene synthase CrtC  58.95 
 
 		 380 aa  482  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000497436  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1781  hydroxyneurosporene synthase  53.72 
 
 		 376 aa  455  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0186399 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1988  hydroxyneurosporene synthase  52.39 
 
 		 376 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0180674  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  50.68 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  21.57 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  24.07 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1357  hypothetical protein  20.82 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000287593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  23.74 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  22.4 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3692  hydroxyneurosporene synthase  25.32 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  21.83 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2952  hydroxyneurosporene synthase  21.53 
 
 		 299 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  26.47 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25950  Protein of unknown function (DUF2006)  25.23 
 
 		 507 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.311446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2047  hydroxyneurosporene synthase  23.1 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.329916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2985  hydroxyneurosporene synthase  25.48 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.813569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1615  hydroxyneurosporene synthase  22.96 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>