17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1781 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1781  hydroxyneurosporene synthase  100 
 
 		 376 aa  783    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0186399 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1988  hydroxyneurosporene synthase  62.5 
 
 		 376 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0180674  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  53.72 
 
 		 376 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0360  hydroxyneurosporene synthase  55.85 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0314991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  55.05 
 
 		 376 aa  448  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1720  hydroxyneurosporene synthase CrtC  55.53 
 
 		 380 aa  443  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000497436  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  47.43 
 
 		 373 aa  362  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1357  hypothetical protein  23.5 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000287593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  22.3 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  23.45 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1148  hypothetical protein  27.44 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  21.95 
 
 		 300 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  21.57 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  22.76 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  20.23 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2952  hydroxyneurosporene synthase  21.65 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25950  Protein of unknown function (DUF2006)  33.33 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.311446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>