24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3692 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3692  hydroxyneurosporene synthase  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  64.19 
 
 		 300 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2952  hydroxyneurosporene synthase  62.88 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2823  hydroxyneurosporene synthase  62.68 
 
 		 286 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.293634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2847  hydroxyneurosporene synthase  62.94 
 
 		 286 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  56.71 
 
 		 319 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  56.38 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  53.69 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  56.52 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  54.7 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2047  hydroxyneurosporene synthase  55.19 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.329916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1615  hydroxyneurosporene synthase  44.98 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1911  hydroxyneurosporene synthase  44.93 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0267  hydroxyneurosporene synthase  44.93 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2985  hydroxyneurosporene synthase  49.6 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.813569  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2041  hydroxyneurosporene synthase  43.48 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.42927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3512  hydroxyneurosporene dehydrogenase  41.39 
 
 		 252 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.411163  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0184  hydroxyneurosporene synthase  42.37 
 
 		 240 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  25.32 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  22.87 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  23.18 
 
 		 376 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1988  hydroxyneurosporene synthase  24.91 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0180674  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0360  hydroxyneurosporene synthase  22.84 
 
 		 376 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0314991  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11201  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>