25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4006 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  100 
 
 		 317 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  88.96 
 
 		 317 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  79.81 
 
 		 317 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  71.38 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  54.14 
 
 		 404 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3692  hydroxyneurosporene synthase  54.7 
 
 		 297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  51.85 
 
 		 300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2952  hydroxyneurosporene synthase  51.18 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2847  hydroxyneurosporene synthase  50.87 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2823  hydroxyneurosporene synthase  50.35 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.293634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2047  hydroxyneurosporene synthase  49.45 
 
 		 283 aa  272  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.329916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1615  hydroxyneurosporene synthase  45.02 
 
 		 275 aa  248  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2985  hydroxyneurosporene synthase  45.6 
 
 		 253 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.813569  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2041  hydroxyneurosporene synthase  40.65 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.42927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0267  hydroxyneurosporene synthase  40.65 
 
 		 279 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1911  hydroxyneurosporene synthase  40.65 
 
 		 279 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3512  hydroxyneurosporene dehydrogenase  40.08 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.411163  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0184  hydroxyneurosporene synthase  38.72 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  22.4 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1988  hydroxyneurosporene synthase  22.97 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0180674  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1781  hydroxyneurosporene synthase  22.39 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0186399 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  22.04 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0360  hydroxyneurosporene synthase  22.62 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0314991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1720  hydroxyneurosporene synthase CrtC  24.44 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000497436  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  22.62 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>