45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3505 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3505  membrane antigen  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.147958 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0381  membrane antigen, putative  49.17 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0329  putative membrane antigen  49.17 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0390  hypothetical protein  43.33 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2035  antigen, putative  48.89 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1113  hypothetical protein  45 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361663  normal  0.175821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3603  putative periplasmic protein  46.24 
 
 		 178 aa  158  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3633  membrane antigen  45.66 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585551  normal  0.0231939 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1740  putative antigen  44.21 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.63433  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0014  putative antigen  48.45 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0606  hypothetical protein  48.45 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0508  hypothetical protein  48.45 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1921  19 kDa periplasmic protein  48.45 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0881  putative antigen  48.45 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0914  putative antigen  48.45 
 
 		 182 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3152  hypothetical protein  45 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2126  hypothetical protein  47.83 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.813368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5537  hypothetical protein  47.85 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4285  membrane antigen  43.75 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.204987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3803  hypothetical protein  47.59 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.0919462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1068  hypothetical protein  47.83 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1957  hypothetical protein  46.25 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2233  hypothetical protein  47.2 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.894017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2209  hypothetical protein  47.2 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5868  hypothetical protein  47.2 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2247  hypothetical protein  47.2 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1397  hypothetical protein  43.75 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00920519  normal  0.0195288 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1169  19 kDa periplasmic protein  41.82 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0525  hypothetical protein  39.77 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.155512  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1831  hypothetical protein  40.48 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2019  hypothetical protein  40.48 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1650  hypothetical protein  40.48 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0432  ProP protein  40.48 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000293439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0449  hypothetical protein  40.25 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0547606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0764  C4-dicarboxylate-binding periplasmic protein  39.87 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2808  hypothetical protein  39.47 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1386  hypothetical protein  37.87 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1784  Ferrous iron transport protein  37.87 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2133  hypothetical protein  37.01 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2251  hypothetical protein  37.01 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2140  hypothetical protein  37.01 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1355  hypothetical protein  30.51 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.957236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1511  pathogen-specific surface antigen, putative  34.62 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1254  Fe2+ high-affinity transport protein  31.95 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0161  pathogen-specific surface antigen family protein  32.26 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.676724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>