45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1355 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1355  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  353  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.957236 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1169  19 kDa periplasmic protein  44.83 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2251  hypothetical protein  46.58 
 
 
175 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2140  hypothetical protein  46.58 
 
 
175 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2133  hypothetical protein  46.58 
 
 
175 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1784  Ferrous iron transport protein  43.53 
 
 
181 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1386  hypothetical protein  43.53 
 
 
175 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0381  membrane antigen, putative  42.2 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0329  putative membrane antigen  42.2 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0432  ProP protein  41.57 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000293439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0390  hypothetical protein  40.72 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0525  hypothetical protein  41.07 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.155512  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4285  membrane antigen  42.24 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.204987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3603  putative periplasmic protein  43.35 
 
 
178 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2035  antigen, putative  40.8 
 
 
183 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1650  hypothetical protein  41.25 
 
 
179 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2019  hypothetical protein  41.25 
 
 
179 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1831  hypothetical protein  41.25 
 
 
179 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0764  C4-dicarboxylate-binding periplasmic protein  42.47 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1113  hypothetical protein  41.89 
 
 
181 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361663  normal  0.175821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1397  hypothetical protein  44.59 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00920519  normal  0.0195288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3152  hypothetical protein  43.24 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5537  hypothetical protein  42.28 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1068  hypothetical protein  42.28 
 
 
183 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353182  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3633  membrane antigen  41.51 
 
 
171 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585551  normal  0.0231939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2233  hypothetical protein  42.95 
 
 
183 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.894017  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2209  hypothetical protein  42.95 
 
 
183 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5868  hypothetical protein  42.95 
 
 
183 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1740  putative antigen  42.28 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.63433  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2126  hypothetical protein  42.95 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.813368  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0508  hypothetical protein  42.28 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0606  hypothetical protein  42.28 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0014  putative antigen  42.28 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1921  19 kDa periplasmic protein  42.28 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0881  putative antigen  42.28 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0914  putative antigen  42.28 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1957  hypothetical protein  41.89 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2247  hypothetical protein  42.95 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0449  hypothetical protein  39.86 
 
 
173 aa  111  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0547606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2808  hypothetical protein  39.73 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3803  hypothetical protein  42.48 
 
 
191 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.0919462 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1254  Fe2+ high-affinity transport protein  36.67 
 
 
227 aa  84.3  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0161  pathogen-specific surface antigen family protein  38.35 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.676724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3505  membrane antigen  30.51 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.147958 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1511  pathogen-specific surface antigen, putative  34.31 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>