45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4285 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4285  membrane antigen  100 
 
 
181 aa  373  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.204987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0390  hypothetical protein  63.13 
 
 
183 aa  230  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0381  membrane antigen, putative  63.69 
 
 
182 aa  229  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0329  putative membrane antigen  63.69 
 
 
182 aa  229  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3603  putative periplasmic protein  57.47 
 
 
178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3633  membrane antigen  64.46 
 
 
171 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585551  normal  0.0231939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1113  hypothetical protein  60.51 
 
 
181 aa  204  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361663  normal  0.175821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3803  hypothetical protein  60.37 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.0919462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1397  hypothetical protein  62.26 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00920519  normal  0.0195288 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2035  antigen, putative  57.14 
 
 
183 aa  197  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3152  hypothetical protein  61.64 
 
 
182 aa  197  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1957  hypothetical protein  61.01 
 
 
182 aa  195  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1068  hypothetical protein  59.49 
 
 
183 aa  191  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353182  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2126  hypothetical protein  59.49 
 
 
183 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.813368  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2233  hypothetical protein  59.49 
 
 
183 aa  190  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.894017  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2209  hypothetical protein  59.49 
 
 
183 aa  190  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5868  hypothetical protein  59.49 
 
 
183 aa  190  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5537  hypothetical protein  59.49 
 
 
183 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0508  hypothetical protein  60.13 
 
 
183 aa  190  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1740  putative antigen  60.13 
 
 
206 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.63433  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0606  hypothetical protein  60.13 
 
 
183 aa  190  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0014  putative antigen  60.13 
 
 
183 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1921  19 kDa periplasmic protein  60.13 
 
 
183 aa  190  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0881  putative antigen  60.13 
 
 
183 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0914  putative antigen  60.13 
 
 
182 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2247  hypothetical protein  59.49 
 
 
183 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1169  19 kDa periplasmic protein  58.75 
 
 
173 aa  177  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1386  hypothetical protein  54.22 
 
 
175 aa  176  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1784  Ferrous iron transport protein  53.61 
 
 
181 aa  175  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2140  hypothetical protein  57.33 
 
 
175 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2133  hypothetical protein  57.33 
 
 
175 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2251  hypothetical protein  57.33 
 
 
175 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0432  ProP protein  52 
 
 
173 aa  168  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000293439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0449  hypothetical protein  55.7 
 
 
173 aa  167  9e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0547606  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1831  hypothetical protein  53.75 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0764  C4-dicarboxylate-binding periplasmic protein  55.63 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2019  hypothetical protein  53.75 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1650  hypothetical protein  53.75 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2808  hypothetical protein  52.7 
 
 
176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0525  hypothetical protein  51.19 
 
 
173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.155512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3505  membrane antigen  43.75 
 
 
183 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.147958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1355  hypothetical protein  42.24 
 
 
173 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.957236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1254  Fe2+ high-affinity transport protein  41.57 
 
 
227 aa  108  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1511  pathogen-specific surface antigen, putative  41.29 
 
 
208 aa  104  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0161  pathogen-specific surface antigen family protein  41.06 
 
 
214 aa  97.8  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.676724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>