46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2233 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2233  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.894017  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2209  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2247  hypothetical protein  98.36 
 
 
183 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5868  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2126  hypothetical protein  98.36 
 
 
183 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.813368  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2035  antigen, putative  90.71 
 
 
183 aa  348  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1068  hypothetical protein  96.72 
 
 
183 aa  338  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353182  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5537  hypothetical protein  96.72 
 
 
183 aa  337  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1740  putative antigen  91.26 
 
 
206 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.63433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1921  19 kDa periplasmic protein  91.26 
 
 
183 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0881  putative antigen  91.26 
 
 
183 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0014  putative antigen  91.26 
 
 
183 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0606  hypothetical protein  91.26 
 
 
183 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0508  hypothetical protein  91.26 
 
 
183 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0914  putative antigen  91.67 
 
 
182 aa  324  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3152  hypothetical protein  83.89 
 
 
182 aa  295  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1397  hypothetical protein  83.89 
 
 
182 aa  290  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00920519  normal  0.0195288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1957  hypothetical protein  83.06 
 
 
182 aa  288  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3603  putative periplasmic protein  66.09 
 
 
178 aa  240  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0329  putative membrane antigen  64.25 
 
 
182 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0381  membrane antigen, putative  64.25 
 
 
182 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1113  hypothetical protein  64.56 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361663  normal  0.175821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0390  hypothetical protein  62.57 
 
 
183 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3633  membrane antigen  61.4 
 
 
171 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585551  normal  0.0231939 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4285  membrane antigen  58.62 
 
 
181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.204987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3803  hypothetical protein  60.37 
 
 
191 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.0919462 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1169  19 kDa periplasmic protein  53.57 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1831  hypothetical protein  53.37 
 
 
179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2019  hypothetical protein  53.37 
 
 
179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1650  hypothetical protein  53.37 
 
 
179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2808  hypothetical protein  49.04 
 
 
176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0432  ProP protein  50.6 
 
 
173 aa  160  7e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000293439  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0525  hypothetical protein  51.48 
 
 
173 aa  159  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.155512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1386  hypothetical protein  47.98 
 
 
175 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1784  Ferrous iron transport protein  47.98 
 
 
181 aa  158  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3505  membrane antigen  45.98 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.147958 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0449  hypothetical protein  50.94 
 
 
173 aa  154  9e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0547606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0764  C4-dicarboxylate-binding periplasmic protein  53.29 
 
 
173 aa  153  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204377  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2140  hypothetical protein  51.32 
 
 
175 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2251  hypothetical protein  51.32 
 
 
175 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2133  hypothetical protein  51.32 
 
 
175 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1355  hypothetical protein  40.23 
 
 
173 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.957236 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0161  pathogen-specific surface antigen family protein  43.71 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.676724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1254  Fe2+ high-affinity transport protein  41.61 
 
 
227 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1511  pathogen-specific surface antigen, putative  42.31 
 
 
208 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2253  hypothetical protein  32.41 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847078  normal  0.717354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>