31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2143 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2143  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  100 
 
 		 148 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583113  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  52.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2705  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  57.35 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2476  putative bacterioferritin  52.63 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3766  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  61.11 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2904  putative bacterioferritin  51.32 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387313  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4162  putative bacterioferritin  60.71 
 
 		 85 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1764  hypothetical protein  56.9 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.842714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2100  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  56.9 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380448  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1530  hypothetical protein  57.14 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.53579  normal  0.412285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2877  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  39.13 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0193473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0112  hypothetical protein  58.93 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0656  hypothetical protein  55.93 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1519  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  54.24 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6132  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  54.24 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4121  putative bacterioferritin  60.71 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0356  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.874807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5937  hypothetical protein  48.15 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1931  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  56.36 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3544  hypothetical protein  50.94 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2582  hypothetical protein  52.73 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0091  hypothetical protein  68.18 
 
 		 553 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0127  hypothetical protein  41.86 
 
 		 504 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1380  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.51 
 
 		 849 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1258  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  34.72 
 
 		 879 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.993726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  37.31 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  37.88 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  37.31 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>