21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5937 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5937  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  58.06 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4162  putative bacterioferritin  53.33 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2476  putative bacterioferritin  50 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2904  putative bacterioferritin  50 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2143  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  48.15 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583113  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2100  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.69 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380448  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1764  hypothetical protein  47.69 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.842714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0112  hypothetical protein  47.37 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1530  hypothetical protein  45.16 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.53579  normal  0.412285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2705  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  48.08 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3766  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0656  hypothetical protein  43.55 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2877  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.08 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0193473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6132  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  44.83 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1519  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  44.83 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4121  putative bacterioferritin  40.74 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3544  hypothetical protein  46.43 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1931  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  37.04 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0356  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.874807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2582  hypothetical protein  34.25 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>