30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1931 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1931  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4121  putative bacterioferritin  68.75 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1530  hypothetical protein  54.69 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.53579  normal  0.412285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2877  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.5 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0193473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2100  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  52.24 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380448  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1764  hypothetical protein  52.17 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.842714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46.15 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2476  putative bacterioferritin  46.84 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4162  putative bacterioferritin  59.26 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2904  putative bacterioferritin  49.35 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0112  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0656  hypothetical protein  54.72 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6132  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  54.72 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1519  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  54.72 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3766  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  59.26 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2143  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  57.41 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583113  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2705  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  55.77 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0356  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.874807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5937  hypothetical protein  37.04 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3544  hypothetical protein  50.85 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2582  hypothetical protein  45.61 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0751  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.38 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.38 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.38 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.38 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.38 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  36.07 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  36.07 
 
 		 79 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  36.07 
 
 		 79 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>