25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2100 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2100  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 		 96 aa  192  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380448  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1764  hypothetical protein  98.96 
 
 		 96 aa  191  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.842714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1530  hypothetical protein  88.54 
 
 		 89 aa  164  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.53579  normal  0.412285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0112  hypothetical protein  70.83 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0656  hypothetical protein  80.88 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6132  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  85 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1519  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  85 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2705  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  67.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  62.5 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2904  putative bacterioferritin  62.5 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387313  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4162  putative bacterioferritin  60.71 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2476  putative bacterioferritin  60.71 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2877  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  48.31 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0193473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3766  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  61.9 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0356  hypothetical protein  44.71 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.874807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2143  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  56.9 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583113  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4121  putative bacterioferritin  58.93 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1931  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  54.55 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2582  hypothetical protein  63.64 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5937  hypothetical protein  47.69 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3544  hypothetical protein  61.11 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3138  hypothetical protein  42.31 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191753  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2764  hypothetical protein  40.68 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  36.92 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2924  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.5 
 
 		 79 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0289108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>