46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6243 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4162  putative bacterioferritin  72.73 
 
 
85 aa  116  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2476  putative bacterioferritin  66.27 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2904  putative bacterioferritin  65.06 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1530  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.53579  normal  0.412285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2705  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  46.99 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0112  hypothetical protein  47.73 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2100  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  62.5 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380448  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1764  hypothetical protein  62.5 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.842714  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2143  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  55.84 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583113  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0656  hypothetical protein  55.22 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2877  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  51.19 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0193473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6132  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  58.93 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1519  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  58.93 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5937  hypothetical protein  58.06 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4121  putative bacterioferritin  58.93 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3766  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.75 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1931  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  50.91 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0356  hypothetical protein  44.44 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.874807  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2582  hypothetical protein  53.62 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3544  hypothetical protein  45.76 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3138  hypothetical protein  42.59 
 
 
56 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191753  normal  0.815455 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.5 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0615  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  38.75 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183857  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2200  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  45.83 
 
 
95 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0320  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.89 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  35.71 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  35.71 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0402  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.07 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000568559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0280  bacterioferritin-associated ferredoxin  36.84 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000223162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  35.71 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  35.71 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.5 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3826  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2764  hypothetical protein  36.36 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.260381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4005  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 
64 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000574852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>