24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4121 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4121  putative bacterioferritin  100 
 
 		 66 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1931  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  71.93 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2476  putative bacterioferritin  58.73 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  58.93 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4162  putative bacterioferritin  57.14 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2904  putative bacterioferritin  55.56 
 
 		 85 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6132  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  58.93 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1519  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  58.93 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1530  hypothetical protein  57.14 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.53579  normal  0.412285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1764  hypothetical protein  58.93 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.842714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2100  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  58.93 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380448  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2705  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  58.93 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0356  hypothetical protein  52.38 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.874807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2143  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  60.71 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583113  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0112  hypothetical protein  57.14 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0656  hypothetical protein  55.36 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2877  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  53.45 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0193473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3766  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  56.36 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2582  hypothetical protein  50.88 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5937  hypothetical protein  40.74 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3544  hypothetical protein  52.83 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2764  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2924  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.62 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0289108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2200  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.71 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>