23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1241 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  63.51 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  63.51 
 
 		 220 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  63.35 
 
 		 216 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  63.96 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  62.61 
 
 		 220 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  55.31 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  41.12 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  56.12 
 
 		 143 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  53.19 
 
 		 145 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  64.63 
 
 		 89 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  53.06 
 
 		 143 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  56.47 
 
 		 96 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  56.47 
 
 		 96 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  50.53 
 
 		 145 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  54.12 
 
 		 96 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  47.06 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4892  hypothetical protein  32.76 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3084  hypothetical protein  29.68 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  57.63 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0913  hypothetical protein  30.38 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.514761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0809  hypothetical protein  29.52 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5244  hypothetical protein  30.45 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>