18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1682 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  185  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  86.17 
 
 
96 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  84.04 
 
 
96 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  85.11 
 
 
96 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  52.78 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  87.1 
 
 
66 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  61.18 
 
 
223 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  53.19 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  48.94 
 
 
143 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  48.94 
 
 
143 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  54.22 
 
 
220 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  54.22 
 
 
220 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  51.76 
 
 
216 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  51.85 
 
 
212 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  51.81 
 
 
220 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  51.81 
 
 
220 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  52.13 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  47.06 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>