8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5244 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5244  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0913  hypothetical protein  74.01 
 
 		 173 aa  247  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.514761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0809  hypothetical protein  72.88 
 
 		 170 aa  237  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4892  hypothetical protein  46.73 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  30.45 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0643  hypothetical protein  39.68 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0745  hypothetical protein  34.92 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  27.03 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>