21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3786 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  55.24 
 
 		 212 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  55.31 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  49.33 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  49.55 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  49.11 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  48.46 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  57.63 
 
 		 143 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  69.41 
 
 		 96 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  53.39 
 
 		 143 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  68.24 
 
 		 96 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  47.01 
 
 		 145 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  50.83 
 
 		 145 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  63.53 
 
 		 96 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  61.18 
 
 		 97 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  75 
 
 		 66 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3084  hypothetical protein  35.23 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  60.71 
 
 		 89 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4892  hypothetical protein  30.38 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0913  hypothetical protein  30.27 
 
 		 173 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.514761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>