21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1681 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  74.89 
 
 		 220 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  75.34 
 
 		 220 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  76.26 
 
 		 220 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  74.43 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  63.35 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  49.33 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  42.99 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  52.59 
 
 		 145 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  55.56 
 
 		 143 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  49.57 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  59.3 
 
 		 96 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  46.43 
 
 		 143 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  56.98 
 
 		 96 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  54.65 
 
 		 96 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  51.76 
 
 		 97 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  64.41 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  61.97 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4892  hypothetical protein  40.12 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3084  hypothetical protein  25.93 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0913  hypothetical protein  27.63 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.514761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>