18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2396 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  93.75 
 
 		 96 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  91.67 
 
 		 96 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  85.11 
 
 		 97 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  63.53 
 
 		 223 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  54.63 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  55.91 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  53.76 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  88.71 
 
 		 66 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  49.47 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  55.06 
 
 		 220 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  55.06 
 
 		 220 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  54.65 
 
 		 216 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  54.22 
 
 		 220 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  56.41 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  54.22 
 
 		 220 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  55.91 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  54.12 
 
 		 218 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>