15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4298 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4298  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.827908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1215  hypothetical protein  68.32 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.763477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4193  hypothetical protein  60.55 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1928  hypothetical protein  76.62 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1182  hypothetical protein  38.04 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1944  hypothetical protein  39.53 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0623  hypothetical protein  48.98 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0134  hypothetical protein  47.27 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3647  hypothetical protein  32.81 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0936  hypothetical protein  39.51 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.9998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1931  hypothetical protein  44.9 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0710  hypothetical protein  44.9 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6228  hypothetical protein  35.29 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0754  hypothetical protein  46.43 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1710  hypothetical protein  36 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>