13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6228 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6228  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1931  hypothetical protein  65.38 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0623  hypothetical protein  40.82 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0936  hypothetical protein  53.57 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.9998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1710  hypothetical protein  46.43 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0710  hypothetical protein  45.35 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1944  hypothetical protein  44.3 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0134  hypothetical protein  45.83 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5864  hypothetical protein  77.5 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2109  hypothetical protein  31.06 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0754  hypothetical protein  43.64 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1182  hypothetical protein  31.33 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4298  hypothetical protein  35.29 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.827908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>