15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1182 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1182  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  215  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1215  hypothetical protein  45.88 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.763477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4193  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4298  hypothetical protein  38.04 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.827908  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1928  hypothetical protein  44.29 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3647  hypothetical protein  46.67 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0623  hypothetical protein  37.62 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0936  hypothetical protein  37.65 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.9998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1944  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0710  hypothetical protein  42.59 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0134  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1710  hypothetical protein  42.37 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1931  hypothetical protein  40.74 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6228  hypothetical protein  31.33 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449021  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0754  hypothetical protein  40.68 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>