16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0134 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  239  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0710  hypothetical protein  62.3 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0623  hypothetical protein  46.24 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0936  hypothetical protein  53.33 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.9998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1944  hypothetical protein  43.96 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1931  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6228  hypothetical protein  50.91 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1710  hypothetical protein  48.21 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0754  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2109  hypothetical protein  31.31 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1182  hypothetical protein  45.45 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4193  hypothetical protein  44.64 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4298  hypothetical protein  47.27 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.827908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1215  hypothetical protein  35.48 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.763477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3647  hypothetical protein  46 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1928  hypothetical protein  44.9 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>