16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0710 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0710  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  249  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0623  hypothetical protein  54.29 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0936  hypothetical protein  47.66 
 
 		 117 aa  91.3  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.9998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0134  hypothetical protein  61.11 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1710  hypothetical protein  47.96 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1944  hypothetical protein  67.24 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1931  hypothetical protein  60 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6228  hypothetical protein  60 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2109  hypothetical protein  39.22 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0754  hypothetical protein  52.46 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1182  hypothetical protein  42.59 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4193  hypothetical protein  40.35 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3647  hypothetical protein  44.9 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4298  hypothetical protein  44.9 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.827908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1215  hypothetical protein  44.9 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.763477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1928  hypothetical protein  40.82 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>