16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1710 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1710  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  267  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0710  hypothetical protein  47.96 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0623  hypothetical protein  51.14 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0936  hypothetical protein  45.92 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.9998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6228  hypothetical protein  47.67 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0134  hypothetical protein  46.23 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1944  hypothetical protein  46.84 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1931  hypothetical protein  50.67 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2109  hypothetical protein  37.11 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1182  hypothetical protein  38.55 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1215  hypothetical protein  34.18 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.763477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4298  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.827908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1928  hypothetical protein  36.73 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5864  hypothetical protein  60.61 
 
 		 44 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0754  hypothetical protein  41.27 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3647  hypothetical protein  42 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>