13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4193 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4193  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4298  hypothetical protein  60.55 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.827908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1215  hypothetical protein  58.42 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.763477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1928  hypothetical protein  70 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1182  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0623  hypothetical protein  35.79 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0936  hypothetical protein  34.07 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.9998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0134  hypothetical protein  44.64 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1944  hypothetical protein  34.41 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0710  hypothetical protein  40.35 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3647  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0754  hypothetical protein  43.1 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1931  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>