264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3185 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
453 aa  902    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2313  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  78.76 
 
 
453 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2373  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.26 
 
 
453 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.16 
 
 
441 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2541  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.68 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.79 
 
 
441 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.551966  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.79 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301435  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0333  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.37 
 
 
444 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3154  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.19 
 
 
446 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2159  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.57 
 
 
441 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301317  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.47 
 
 
441 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0766234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.74 
 
 
438 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.748886  normal  0.0205845 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2219  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.61 
 
 
438 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.867959  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1040  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.42 
 
 
441 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0318758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.64 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.2 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0970  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.55 
 
 
441 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3124  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60 
 
 
438 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.08 
 
 
445 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.445117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.01 
 
 
447 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3359  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.67 
 
 
460 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3518  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.49 
 
 
422 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.19647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.02 
 
 
431 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198297  normal  0.0303559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1889  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.59 
 
 
436 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.659609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1296  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.25 
 
 
436 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.14 
 
 
436 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.913176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2123  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.72 
 
 
435 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226797  hitchhiker  0.00769752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.21 
 
 
429 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.138174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2623  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.09 
 
 
436 aa  346  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0367802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.6 
 
 
436 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0244195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4184  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.72 
 
 
460 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.7 
 
 
464 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.37 
 
 
464 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.99 
 
 
450 aa  276  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43 
 
 
454 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2119  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43 
 
 
455 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0264172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2056  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43 
 
 
455 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.45 
 
 
454 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.61 
 
 
454 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1001  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.37 
 
 
467 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.22 
 
 
464 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0224312  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.9 
 
 
465 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000497962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.63 
 
 
458 aa  259  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2607  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.37 
 
 
454 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0470  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.6 
 
 
462 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.76 
 
 
441 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.328334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0926  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.79 
 
 
482 aa  257  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2890  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.48 
 
 
463 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3894  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.68 
 
 
460 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0538501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0574  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.28 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.83 
 
 
480 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.08 
 
 
489 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0327  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.96 
 
 
440 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.580612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0635  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.9 
 
 
467 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873806  normal  0.509374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1429  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  38.27 
 
 
447 aa  248  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.22 
 
 
460 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5366  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.03 
 
 
465 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 
488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4466  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.81 
 
 
430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.360132  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1187  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  38.52 
 
 
439 aa  246  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0036  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.2 
 
 
460 aa  246  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1850  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.52 
 
 
454 aa  246  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5859  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.19 
 
 
465 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2254  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.96 
 
 
538 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.09 
 
 
454 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3750  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.14 
 
 
437 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1072  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  37.1 
 
 
433 aa  240  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2136  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0437  cobrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0472  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  40 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1007  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.93 
 
 
442 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.09 
 
 
460 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_002936  DET0128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.59 
 
 
463 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_135  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 
463 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2191  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  36.36 
 
 
452 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.56 
 
 
460 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0243  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.73 
 
 
463 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.44 
 
 
465 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.32 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3379  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.18716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0078  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.67 
 
 
469 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826564 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0079  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
450 aa  234  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.786214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0277  glutamine amidotransferase  38.6 
 
 
435 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1673  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.91 
 
 
431 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637615  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2257  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.3 
 
 
459 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09381  putative cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.04 
 
 
475 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2297  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.62 
 
 
557 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368045  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2157  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.3 
 
 
459 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.98 
 
 
510 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.5 
 
 
465 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4046  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.68 
 
 
431 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2158  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  36.15 
 
 
439 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2211  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.65 
 
 
459 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.65 
 
 
459 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.08 
 
 
459 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.24 
 
 
462 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1709  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  38.43 
 
 
431 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4034  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.79 
 
 
427 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1642  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.77 
 
 
431 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5883  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.39 
 
 
478 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00172766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>