45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1339 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4031  hypothetical protein  96.17 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4752  protein of unknown function DUF1013  90.21 
 
 		 238 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3746  hypothetical protein  90.6 
 
 		 234 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2690  hypothetical protein  89.79 
 
 		 233 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.574701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4079  hypothetical protein  89.36 
 
 		 233 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0671297  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0947  hypothetical protein  87.23 
 
 		 231 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2354  hypothetical protein  68.22 
 
 		 233 aa  323  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6075  hypothetical protein  62.18 
 
 		 239 aa  314  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6611  protein of unknown function DUF1013  62.76 
 
 		 239 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1737  hypothetical protein  63.56 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0812871  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1678  hypothetical protein  63.56 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3414  hypothetical protein  64.17 
 
 		 230 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4645  protein of unknown function DUF1013  63.75 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4278  hypothetical protein  63.75 
 
 		 232 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4795  protein of unknown function DUF1013  64.17 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.490477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1175  hypothetical protein  63.14 
 
 		 229 aa  298  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3292  protein of unknown function DUF1013  59.41 
 
 		 239 aa  298  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3195  hypothetical protein  64.6 
 
 		 232 aa  294  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4378  hypothetical protein  60.76 
 
 		 231 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0093  hypothetical protein  61.97 
 
 		 236 aa  292  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.521548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3921  protein of unknown function DUF1013  61.34 
 
 		 235 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4246  protein of unknown function DUF1013  61.6 
 
 		 234 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.149014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1610  hypothetical protein  61.25 
 
 		 236 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0164  hypothetical protein  60.53 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2090  hypothetical protein  57.55 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0230332  hitchhiker  0.0000454152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2574  hypothetical protein  53.28 
 
 		 222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2258  hypothetical protein  61.75 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0517  hypothetical protein  60.92 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0545952  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2632  hypothetical protein  61.49 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2369  hypothetical protein  59.2 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.46966  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0714  hypothetical protein  59.2 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3880  hypothetical protein  56.9 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.107901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0063  hypothetical protein  54.8 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1055  hypothetical protein  58.64 
 
 		 206 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.864998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0255  protein of unknown function DUF1013  58.02 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1606  hypothetical protein  54.14 
 
 		 195 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0912  hypothetical protein  53.37 
 
 		 239 aa  207  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0124991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0020  hypothetical protein  49.35 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3509  protein of unknown function DUF1013  53.41 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216055  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0367  hypothetical protein  52.35 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.362236 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0199  hypothetical protein  46.47 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0136  hypothetical protein  45.88 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0505  hypothetical protein  45.62 
 
 		 183 aa  151  8e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000247387  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0796  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.60185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>