45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2090 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2090  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0230332  hitchhiker  0.0000454152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6075  hypothetical protein  59.67 
 
 		 239 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6611  protein of unknown function DUF1013  58.87 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0947  hypothetical protein  60.66 
 
 		 231 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4752  protein of unknown function DUF1013  59.09 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4079  hypothetical protein  57.61 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0671297  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2690  hypothetical protein  59.74 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.574701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3746  hypothetical protein  58.68 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4795  protein of unknown function DUF1013  58.37 
 
 		 234 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.490477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1339  hypothetical protein  57.55 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2354  hypothetical protein  56.9 
 
 		 233 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4031  hypothetical protein  57.02 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3414  hypothetical protein  57.92 
 
 		 230 aa  268  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0093  hypothetical protein  56.97 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.521548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4645  protein of unknown function DUF1013  58.78 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4278  hypothetical protein  58.78 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1678  hypothetical protein  56.97 
 
 		 229 aa  264  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1737  hypothetical protein  56.97 
 
 		 229 aa  264  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0812871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2574  hypothetical protein  68.68 
 
 		 222 aa  264  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3292  protein of unknown function DUF1013  55.24 
 
 		 239 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1175  hypothetical protein  56.1 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3195  hypothetical protein  57.08 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1610  hypothetical protein  57.09 
 
 		 236 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0164  hypothetical protein  52.61 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4378  hypothetical protein  55.88 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4246  protein of unknown function DUF1013  53.36 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.149014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3921  protein of unknown function DUF1013  53.36 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2258  hypothetical protein  53.88 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0517  hypothetical protein  53.33 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0545952  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0912  hypothetical protein  55.13 
 
 		 239 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0124991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0714  hypothetical protein  61.54 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2369  hypothetical protein  61.54 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.46966  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3880  hypothetical protein  60.77 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.107901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0255  protein of unknown function DUF1013  51.55 
 
 		 250 aa  234  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2632  hypothetical protein  49.79 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1055  hypothetical protein  58.12 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.864998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1606  hypothetical protein  60.67 
 
 		 195 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0063  hypothetical protein  58.66 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0199  hypothetical protein  55.38 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0136  hypothetical protein  55.68 
 
 		 213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3509  protein of unknown function DUF1013  58.43 
 
 		 192 aa  218  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216055  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0020  hypothetical protein  59.39 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0367  hypothetical protein  55.79 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.362236 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0505  hypothetical protein  46.29 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000247387  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0796  hypothetical protein  39.74 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.60185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>