45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3414 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3414  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1737  hypothetical protein  78.7 
 
 
229 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0812871  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1678  hypothetical protein  78.7 
 
 
229 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1175  hypothetical protein  78.26 
 
 
229 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3195  hypothetical protein  80 
 
 
232 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4246  protein of unknown function DUF1013  76.92 
 
 
234 aa  348  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.149014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3921  protein of unknown function DUF1013  76.92 
 
 
235 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4378  hypothetical protein  73.08 
 
 
231 aa  348  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4752  protein of unknown function DUF1013  66.09 
 
 
238 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4079  hypothetical protein  66.81 
 
 
233 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0671297  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0947  hypothetical protein  67.09 
 
 
231 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2690  hypothetical protein  66.39 
 
 
233 aa  311  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.574701  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3746  hypothetical protein  65.82 
 
 
234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4031  hypothetical protein  64.38 
 
 
235 aa  307  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1339  hypothetical protein  64.17 
 
 
235 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6611  protein of unknown function DUF1013  65.55 
 
 
239 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0164  hypothetical protein  67.11 
 
 
233 aa  304  9.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6075  hypothetical protein  65.13 
 
 
239 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4795  protein of unknown function DUF1013  65.38 
 
 
234 aa  300  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.490477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4645  protein of unknown function DUF1013  65.38 
 
 
232 aa  298  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0093  hypothetical protein  63.52 
 
 
236 aa  298  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.521548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2354  hypothetical protein  65.69 
 
 
233 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4278  hypothetical protein  64.96 
 
 
232 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3292  protein of unknown function DUF1013  63.03 
 
 
239 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1610  hypothetical protein  62.5 
 
 
236 aa  275  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2090  hypothetical protein  57.92 
 
 
242 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0230332  hitchhiker  0.0000454152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2574  hypothetical protein  65.29 
 
 
222 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0912  hypothetical protein  57.58 
 
 
239 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0124991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3880  hypothetical protein  62.72 
 
 
255 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.107901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0517  hypothetical protein  63.16 
 
 
253 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0545952  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2632  hypothetical protein  61.9 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2258  hypothetical protein  61.99 
 
 
248 aa  224  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2369  hypothetical protein  61.4 
 
 
248 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.46966  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0714  hypothetical protein  61.4 
 
 
248 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0255  protein of unknown function DUF1013  48.39 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0063  hypothetical protein  58.82 
 
 
234 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1055  hypothetical protein  59.76 
 
 
206 aa  214  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.864998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1606  hypothetical protein  58.96 
 
 
195 aa  207  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0020  hypothetical protein  61.88 
 
 
225 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0367  hypothetical protein  58.82 
 
 
220 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.362236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3509  protein of unknown function DUF1013  60.12 
 
 
192 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216055  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0199  hypothetical protein  50.6 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0136  hypothetical protein  50.6 
 
 
213 aa  189  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0505  hypothetical protein  51.57 
 
 
183 aa  160  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000247387  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0796  hypothetical protein  37.74 
 
 
200 aa  112  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.60185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>