42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_R0032 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0147918 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0033  tRNA-Arg  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.88902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0025  tRNA-Arg  98.41 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.797494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0059  tRNA-Arg  98.41 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0124  tRNA-Arg  98.41 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.305911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0033  tRNA-Arg  98.41 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0099  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0024  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.002495  normal  0.173254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0099  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t032  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0108  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0090  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0051  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0053  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0084  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t078  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0055  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.782572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0054  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08800  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0702581  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0039  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0028  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0027  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0040  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0021  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0022  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0022  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0015  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0792154  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0018  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28780  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0021  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.489181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0022  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.189189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0031  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>