44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_R0090 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_R0090  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0108  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0099  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t032  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0051  tRNA-Arg  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0054  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0084  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.782572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t078  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0099  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0124  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.305911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0059  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0025  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.797494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0033  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0033  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.88902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0032  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0147918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0024  tRNA-Arg  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.002495  normal  0.173254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0043  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0003  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0053  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0044  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4297  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.801361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0586  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0069  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0036  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0035  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0032  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0032  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0016  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.448611  normal  0.584402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>