16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2101 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2101  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3475  hypothetical protein  68.21 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2221  sarcosine oxidase, gamma subunit  63.35 
 
 		 190 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.818428  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2449  sarcosine oxidase, gamma subunit  65.29 
 
 		 190 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0455  hypothetical protein  24.34 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.847985  normal  0.256797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5917  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  29.66 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  29.14 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  38.96 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  28.86 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.19 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.7 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  25.14 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  27.52 
 
 		 211 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.33 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.33 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>