14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0087 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  213  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  94.79 
 
 		 105 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  92.71 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  85.06 
 
 		 100 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5157  hypothetical protein  68.97 
 
 		 97 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5302  hypothetical protein  67.82 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5247  hypothetical protein  67.82 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2468  hypothetical protein  41.25 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3468  hypothetical protein  40.26 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773986  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  38.81 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2300  hypothetical protein  33.78 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.750268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4043  hypothetical protein  35.94 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.131676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5362  hypothetical protein  33.82 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>