15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4043 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4043  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.131676  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  59.15 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  54.93 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5362  hypothetical protein  54.39 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0341  hypothetical protein  57.14 
 
 
77 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4916  hypothetical protein  56.14 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000285344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  31.51 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  33.7 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  33.71 
 
 
153 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4069  hypothetical protein  32.88 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000330915  unclonable  0.000000659796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1771  hypothetical protein  32.39 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372178  decreased coverage  0.000314834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1807  hypothetical protein  32.39 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.512803  normal  0.194465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  35.94 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0223  hypothetical protein  34.67 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.841238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>